Mac OS X の Finder からは、*.app と名前の付いたフォルダは "アプリケーションパッケージ (バンドル)" として見えます。
Windows から見るとただのフォルダです。OS X 上でもターミナルで ls とかすると本来のディレクトリ構造を見る事ができます。

[アーカイブ - 役立つ Mac OS X 用語集: バンドルとは？ (Apple)]
http://support.apple.com/kb/TA25630?viewlocale=ja_JP

[バンドル構造 (英語)]
http://developer.apple.com/library/mac/documentation/CoreFoundation/Conceptual/CFBundles/BundleTypes/BundleTypes.html#//apple_ref/doc/uid/10000123i-CH101-SW1